多生物体细菌成像数据集

摘要：该多生物体细菌成像数据集包含629张高分辨率图像，涵盖10种临床相关细菌（黑曲霉、枯草芽孢杆菌、白色念珠菌、产孢梭菌、粪肠球菌、大肠杆菌、肺炎克雷伯菌、铜绿假单胞菌、金黄色葡萄球菌、化脓性链球菌）的两种成像方式：革兰氏染色显微镜（显示细胞壁结构、形态、革兰氏阳性/阴性分类）和培养基平板培养（显示菌落形态、生长特征、色素沉着）。

数据集概述

该多生物体细菌成像数据集包含629张高分辨率图像，涵盖10种临床相关细菌（黑曲霉、枯草芽孢杆菌、白色念珠菌、产孢梭菌、粪肠球菌、大肠杆菌、肺炎克雷伯菌、铜绿假单胞菌、金黄色葡萄球菌、化脓性链球菌）的两种成像方式：革兰氏染色显微镜（显示细胞壁结构、形态、革兰氏阳性/阴性分类）和培养基平板培养（显示菌落形态、生长特征、色素沉着）。数据集包含20个分类类别（10种生物×2种成像类型），每类26-53张图像，平均31张。

数据结构与关键特征

数据集按生物体和成像类型组织为标准化文件夹结构，每种细菌包含革兰氏染色和培养基平板两个子文件夹。图像为PNG格式高分辨率数字图像，训练时标准化为224×224像素。包含全面的CSV元数据文件（dataset_full.csv、dataset_labels.csv、dataset_summary.csv）和类映射文件。数据采用一致成像方案和预处理，保持标准化质量控制，捕捉细菌形态自然变异和染色强度差异，代表典型临床和实验室影像学情况。

应用价值与研究方向

该数据集可用于自动细菌分类、CRISPR靶标识别、抗菌药物耐药性分析等研究。研究方向包括多类别分类（20类）、跨模态学习（革兰氏染色↔培养基平板）、形态特征提取、生物膜检测、将形态特征与耐药性模式关联、基于图像的AMR预测、生物膜基因检测、多智能体系统用于基因靶标推荐、临床决策支持系统等，对快速细菌鉴定、临床实验室诊断工作流程、自动化抗菌干预设计、医院感染控制、推动计算机视觉在临床微生物学中的应用具有重要价值。

数据集来源

由张家梁(Bob)整理并于2026年在7zcode平台公开发布。

数据集信息

免责声明与引用

数据仅用于科研与教学用途。若用于商业场景，请自行核验数据许可。如需引用，请在论文或报告中注明数据集名称与版本号。

作者信息

作者：Bob (张家梁)
项目编号：Datasets-353
文件大小：300M
原创声明：本数据集为整理作品

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开源协议

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