摘要:合成患者记录电子病历数据集是一个人工生成的 EHR 数据集(10万患者、15种疾病、5个文件),基于 CDC/NIH/NHANES 数据校准,专为规避 HIPAA 限制的临床机器学习和医学教育而构建,仅供研究使用。
数据集简介
数据集概述
合成患者记录电子病历数据集(2018-2024)是一个人工生成的 EHR 数据集,模拟 10万名美国成年患者(18-95岁)的临床数据,涵盖 15 种常见疾病。数据集基于 CDC/NIH/NHANES 公共卫生数据构建,反映真实的疾病流行率、实验室范围和用药模式,用于规避 HIPAA 限制。包含 5 个文件:patients.csv(10万患者)、diagnoses.csv(约27.4万诊断记录含 ICD-10)、medications.csv(约24.5万处方)、lab_results.csv(约220万检测值)、outcomes.csv(约1.08万住院记录)。专为临床机器学习、生存分析、再入院预测和医学 NLP 研究而构建,仅供研究和教育使用。
数据结构与校准基准
数据集采用多表关系结构,通过 patient_id 关联 5 个核心文件。patients.csv(10万行) 包含人口统计信息(年龄、性别)、生命体征(BMI 16.0-55.0、收缩压、舒张压、心率)、生活方式(吸烟状况:从不/以前/当前、饮酒:无/轻度/中度/重度、运动水平:久坐/轻度/中度/剧烈)、保险类型(商业保险/联邦医疗保险/医疗补助/无保险/三军医疗保险)、Charlson 合并症指数(0-8+,死亡风险指标)和 15 种疾病的二元标志(如 dx_hypertension, dx_type2_diabetes)。15 种模拟疾病包括:高血压(ICD-10: I10,患病率 47%)、肥胖(E66.9,42%)、高脂血症(E78.5,38%)、慢性肾脏病(N18.3,15%)、2型糖尿病(E11.9,11%)、骨关节炎(M19.90,13%)、哮喘(J45.909,8%)、抑郁(F32.9,9%)、焦虑(F41.9,8%)、慢性阻塞性肺病(J44.1,6%)、甲状腺功能减退(E03.9,5%)、冠状动脉疾病(I25.10,7%)、心力衰竭(I50.9,2%)、心房颤动(I48.91,2%)和 1型糖尿病(E10.9,0.5%)。lab_results.csv(约220万行) 包含关键实验室检测:糖化血红蛋白(HbA1c,4.0-5.6%,>6.5%为糖尿病)、空腹血糖(70-99 mg/dL)、低密度脂蛋白 LDL(0-99 mg/dL)、总胆固醇、肌酐(0.6-1.2 mg/dL)、肾小球滤过率 eGFR(60-120 mL/min,<60为慢性肾病)、促甲状腺激素 TSH(0.4-4.0 mIU/L)、BNP(心力衰竭标志物)、肌钙蛋白 I(心脏损伤标志物)和血红蛋白。outcomes.csv(约1.08万行) 包含住院结果:住院时长(1-30天)、ICU 入住(约10.8%住院率)、院内死亡(约1.4%死亡率)、出院去向(首页/家庭护理/专业护理/康复/临终关怀/已过期)、30天再入院(约15.2%再入院率)和医院总费用。数据集校准至:CDC NHANES(生命体征、实验室参考范围)、CDC 国家卫生统计中心(疾病患病率)、CMS Medicare/Medicaid(住院和再入院基准)、WHO ICD-10 分类系统(诊断代码)。
应用价值与研究方向
该数据集为临床预测建模、医疗数据科学教育和健康信息学研究提供全面数据支撑,支持多个关键应用方向。临床预测模型:30天再入院预测(经典临床机器学习任务,特征包括年龄、Charlson 指数、住院时长、诊断、生命体征,目标为 readmitted_30d,挑战为类别不平衡约15%阳性率)、住院时长预测、ICU 入住风险预测、院内死亡率预测。实验室值预测/插补:根据人口统计和合并症预测缺失的实验室值(在实际 EHR 系统中常见,因为并非所有检测都会被开具)。生存分析:使用 outcomes.csv + patients.csv 进行事件发生时间分析,Cox 比例风险模型,按疾病亚组绘制 Kaplan-Meier 生存曲线。药物依从性:根据患者特征预测 adherence_pct(依从性百分比),低依从性(<80%)是主要临床问题。多病共存聚类:使用疾病标记(dx_* 列)通过 k-means 或 LDA 识别患者亚组,分析哪些疾病聚集在一起。医学 NLP / 合成文本生成:利用结构化数据生成合成临床笔记。药物相互作用分析:查找正在服用多种药物的患者,标记潜在相互作用(如华法林+阿司匹林)。人口健康分析:按年龄、性别、保险类型分析疾病患病率,重现 CDC 风格的流行病学数据。Charlson 合并症指数研究:CCI 是经过验证的死亡风险评分,CCI 越高表示住院、ICU 入住和院内死亡概率越高。数据集统计:性别比例 49% 男 / 51% 女,平均年龄约52岁,平均 Charlson 指数约1.8,约87%患者患有≥1种疾病,约45%患者患有≥3种疾病。局限性:(1) 病情没有时间上的进展(固定在”当前状态”);(2) 不包含儿科患者(仅18岁以上成人);(3) 简化的以美国为中心的保险模式;(4) 无影像或基因组数据;(5) 实验室数值均为独立采集(无患者纵向趋势);(6) 无程序代码(CPT/HCPCS);(7) 作为合成数据,可能无法完全反映真实临床实践的复杂性。
数据集来源
该数据集为人工生成的合成数据(10万患者、15种疾病、5个文件),基于 CDC NHANES、CDC 卫生统计、CMS Medicare/Medicaid 和 WHO ICD-10 公共卫生数据校准,专为规避 HIPAA 限制的临床机器学习和医学数据科学教育而构建,仅供研究使用。由张家梁(Bob)整理并于2026年在7zcode平台公开发布。
数据集信息
免责声明与引用
数据仅用于科研与教学用途。若用于商业场景,请自行核验数据许可。如需引用,请在论文或报告中注明数据集名称与版本号。
作者信息
作者:Bob (张家梁)
项目编号:Datasets-84
文件大小:30M
原创声明:本数据集为整理作品
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开源协议
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